サンプル調製 (Sample Preparation)
PCR EZ にはどのようなサンプルを準備すればよいですか？
- クローン由来・直鎖状・精製済みの二本鎖DNA（dsDNA）PCR産物
- 濃度：50 ng/µL に正規化
- 最小容量：10 µL
- 提出形態：マイクロ遠心チューブ、密封済み96ウェルプレート、またはキャップ付きPCRストリップチューブ
- クローン由来・直鎖状・未精製の二本鎖DNA（dsDNA）PCR産物
- 最小容量：10 µL
- 提出形態：マイクロ遠心チューブ、密封済み96ウェルプレート、またはキャップ付きPCRストリップチューブ
開始サンプルは 50 ng/µL に正規化する必要がありますか？
はい。ライブラリ調製前に当社で濃度調整は行わず、各サンプルは同一体積で処理します。
最適な結果を得るため、提出前に 50 ng/µL に調整してください。
- 推奨定量法：Qubit™、PicoGreen™ などの dsDNA 定量アッセイ
酵素精製後に希釈最適化の参考とするため、アガロースゲル画像の添付を推奨します。
提出可能な PCR アンプリコンのサイズ範囲は？
- 500 bp ～ 25 kb の PCRアンプリコンが解析可能です。
- 25 kbを超える場合は、技術的な相談のため事前にお問い合わせください。
サンプルと一緒にプライマーを同梱する必要はありますか？
いいえ。PCR EZ では プライマーを使用せずにシーケンスを行います。そのため、プライマーは送付・混合の必要はありません。
複数の PCR アンプリコンの混合物を解析できますか？
できません。本サービスは クローン由来の単一アンプリコン集団を対象としています。詳細はTroubleshooting（トラブルシューティング）をご参照ください。
開始材料の要件を満たさない場合はどうなりますか？
お問い合わせください。担当者が対応可能な選択肢についてご連絡します。
サンプル提出 (Sample Submission)
サンプルはいつ提出できますか？
- いつでも提出可能です
- 当日解析の対象となるには、午前中に当社施設へ到着する必要があります
- 情報が不完全なプロジェクトは次回サイクルに回される場合があります
- 結果は、1~3 営業日で納品されます
PCR-EZ のサンプル提出ガイドラインは？
- 精製リニア PCR
- サンプルタイプ：精製アンプリコン DNA
- サイズ：500 bp ～ 25 kb
※ 25 kb を超える場合は、技術相談のため お問い合わせください - 最小量：500 ng
（Qubit™ や PicoGreen™ などの dsDNA 定量アッセイの使用を推奨） - 濃度：50 ng/µL に正規化
- 純度（A260/280）：1.8～2.0
- バッファー：水、EB、低濃度 TE（EDTA <0.1 mM）
- 未精製リニア PCR
- サンプルタイプ：未精製アンプリコン DNA
- サイズ：500 bp ～ 25 kb
※ 25 kb を超える場合は、技術相談のため お問い合わせください - 濃度推定と希釈最適化のため ゲル画像の提出を推奨
- バッファー：水、EB、低濃度 TE（EDTA <0.1 mM）
チューブ／プレートの準備方法は？
48 サンプル未満
- 0.2 mL の 8 連 PCR ストリップチューブおよびキャップを使用してください。
- 空のチューブは切り離して、次回以降に再利用できます。
- 当社のオンライン注文システムでは、お客様のイニシャルとサンプル番号を使用したチューブ IDが割り当てられます（下図参照）。
- これらのIDを 油性ペンでチューブ側面に記載してください。
- チューブの側面には、お客様のイニシャルとサンプル番号を記載してください。
- これらは 注文書と一致している必要があります。
- 96 ウェル・セミスカート付き PCR プレートの使用を推奨します。
- 各ウェルは 8 連キャップで密閉してください。（プレートとは別売りの場合があります）。
- キャップが確実に密閉されていることを必ず確認してください。
- セミスカート付きプレートは、輸送中の反りを防ぎ、キャップ外れを減らします。
- 輸送時には、破損防止のため必ず緩衝材を使用してください。
- サンプルは、右図のように縦方向（カラム）に配置してください。
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サンプルの送付方法は？
- 注文書（Order Receipt）とサンプルをジップ袋へ同封
- ドロップボックスの場所は dnaseq.jp@azenta.com へお問い合わせください
- 注文書に記載の GENEWIZ(アゼンタ)日本ラボへ発送
- 常温・送料無料で発送可能
ドロップボックスの締切時間は？
- 注文時に、最寄りのドロップボックスを選択します。
- チェックアウト時の注文概要のページに、選択したドロップボックスの当日の締切時刻が表示されます。
- 締切に間に合わない場合は、直接発送してください。
注文・処理 (Ordering & Processing)
なぜ PCR-EZ を選ぶべきなのか？
PCR-EZはどのように注文しますか
見積を取得することなく、数分で PCR-EZ を注文できます。ウェブサイトにアクセスし、オンラインアカウントにログインして注文してください。
アンプリコン当たりどの程度のカバレッジが期待されますか？
PCR-EZのプロジェクトの進捗はどのように確認できますか?
注文の推定納期は、オンラインアカウントのOrder Summary ページからいつでも確認できます。本サービスは迅速な納期で結果を提供しているため、QC、ライブラリ調製、シーケンス、データ解析の各工程に関する詳細な進捗情報（例：タイムスタンプ）は提供していません。解析日の午前到着で最短で1営業日で納品します。
納期を教えてください
解析スケジュール（週3回：月･火・水）に従い実行します。解析日の午前到着で最短で1営業日で納品します。
ライブラリ調整前にPCR-EZサンプルのQC は実施されますか?
いいえ。迅速・低コスト提供のため サンプル QC は行いません。提出前に 50 ng/µL に調整してください（Qubit™ や PicoGreen™ などの dsDNA 定量アッセイの使用を推奨）。
結果 (Results)
PCR-EZから得られるデータは何ですか?
クローン由来PCR産物の場合、以下のデータが提供されます。
- インタラクティブレポート
- アンプリコンのコンセンサス配列（FASTA 形式）
- RAW リード（FASTQ）
- バリアントレポート
どのようにデータをダウンロードしますか?
オンラインアカウントを通じてダウンロードができます。
データセキュリティはどのようになっていますか?
はい。当社はデータセキュリティを非常に重要視しており、お客様のデータを非公開かつ安全に保護するため最大限の努力を行っています。提供しているデータ転送方法は安全ですが、別の納品方法をご希望の場合は、柔軟に対応しますのでご相談ください。
追加のバイオインフォマティクス解析は可能ですか?
すべてのカスタムバイオインフォマティクス解析の依頼は、技術相談後にケースバイケースで対応しています。標準納品物以外のカスタマイズ解析については、追加の費用および時間が発生する場合がありますのでご了承ください。
トラブルシューティング (Troubleshooting)
シーケンス不良やコンセンサス未生成の場合はどうなりますか？
シーケンス失敗（すなわち、10× カバレッジ以上のコンセンサス配列が得られない場合）は、以下の要因による可能性があります。
- 必要な DNA 濃度でサンプルが調製されていない
- 混合プラスミド集団が含まれている
- DNA が劣化または断片化している
最適なシーケンス結果を得るために、推奨しているサンプル提出ガイドラインに従ってください。
結果が想定と異なる場合はどうなりますか？
シーケンスデータの結果は保証されません。処理上のエラーが発生した可能性があると考えられる場合は、当社までご連絡ください。ケースごとに調査を行います。